Organizarea unei infrastructuri experimentale pentru intretinerea si caracterizarea unei colectii (banci) de microorganisme cu multiple utilitati biotehnologice

Raport de Cercetare

Grant: Organizarea unei infrastructuri experimentale pentru intretinerea si caracterizarea unei colectii (banci) de microorganisme cu multiple utilitati biotehnologice.

In ultimele decenii microorganismele au influentat din ce in ce mai mult intreaga activitate umana, dintre care amintim:

cercetarile realizate in domeniul sanitar au condus, pe de o parte, la identificarea a foarte multe microorganisne implicate in enorm de multe boli la om si animale, iar pe de alta parte, la folosirea microorganismelor in cercetarile de terapie genica;

in industria farmaceutica, s-au impus in ultimii 20 de ani o serie de procese biotehnologice ce utilizeaza microorganisme pentru obtinerea unor substante cu valoare terapeutica;

in domeniul biotehnologiilor alimentare se folosesc in ultimii ani din ce in ce mai multe tulpini microbiene cu caractere mult ameliorate;

in industria extractiva au fost dezvoltate si procedee de extractie a unor metale din minereuri cu ajutorul microorganismelor;

in ultimii 15 ani procesele de poluare globala sunt abordate prin prisma biotehnologiilor de bioremediere mediata de microorganisme, studiile stiintifice impunand izolarea si caracterizarea de noi tulpini microbiene din diverse medii poluate;

in ultimul deceniu, intreaga comunitate stiintifica internationala acorda o atentie deosebita studiilor privind estimarea biodiversitatii microorganismele in extrem de diverse tipuri de ecosisteme;

nu in ultimul rand, comunitatea stiintifica este preocupata de problemele de aparitie si evolutie a vietii pe Pamant, de filogenie moleculara a organismelor (inclusiv de constructie de arbori filogenetici).

Ca urmare, pe plan international, s-a impus necesitatea identificarii taxonomice de inalta acuratete a unor extrem de diverse tipuri de microorganisme izolate din medii naturale.

Problema taxonomiei in lumea bacteriana (marea majoritate a microorganismelor implicate in procesele listate mai sus apartin domeniului Bacteria) a suscitat in ultimii 20 de ani controverse stiintifice profunde. Astfel, pana in anii 1970 - 1975, sistematica bacteriana folosea doar asa-numita taxonomie conventionala, bazandu-se strict pe informatii fenotipice - trasaturi morfologice, structurale, fiziologice si biochimice. Incepand din anii 80 insa, au luat o amploare deosebita cercetarile de nivel molecular, cristalizandu-se in final taxonomia moleculara, ce se bazeaza in mod special pe informatii genotipice (procent molar de guanina+citozina din ADN cromozomal, hibridizare ADN:ADN, secventierea genelor ce codifica molecule de ARN ribozomal etc).

La jumatatea deceniului trecut insa, o serie de cercetatori recunoscuti in domeniul taxonomiei bacteriilor, au argumentat in favoarea unei abordari de tip integrator in ceea ce priveste identificarea si incadrarea taxonomica a tulpinilor bacteriene, utilizand asa-numita taxonomie polifazica (Vandamme, 1996). In acest scop, taxonii bacterini sunt definiti pe baza informatiilor obtinute de diverse discipline, reunind astfel atat date fenotipice (cunoscute ca facand parte din taxonomia conventionala), cat si date de nivel molecular (taxonomia moleculara, chemotaxonomia).

Pe de alta parte, in ultimul deceniu s-a facut simtita necesitatea standardizarii internationale a testelor de fiziologie microbiana, astfel ca rezultatele obtinute sa poata fi comparabile de la un laborator la altul. In acest sens, s-au impus 2 sisteme microtest automatizate:

q      sistemul API, produs de firma Biomerieux, Paris, Franta; acest sistem prezinta o inalta specializare in mod particular pentru tulpinile bacteriene patogene sau potential-patogene;

q      sistemul BIOLOG, produs de firma BIOLOG Inc, California, SUA; acest sistem dispune de baze de date mai extinse pentru tulpini microbiene (atat bacteriene, cat si de drojdii) izolate din diverse ecosisteme naturale.

Centrul de cercetare, formare si consultanta in Microbiologie, Genetica si Biotehnologie (MICROGEN) din Universitatea din Bucuresti are in derulare un set de proiecte stiintifice (multe din ele fac si obiectul unor teze de doctorat), dezvoltand totodata si o colectie de aproximativ 2000 de tulpini de microorganisme cu multiple utilitati: tulpini de microorganisme (bacterii si drojdii) cu capacitati xenodegradative, tulpini de drojdii "non-conventionale", tulpini naturale de microorganisme (bacterii lactice si drojdii) cu potential probiotic, tulpini de bacterii patogene sau potential-patogene. Totodata, in colectia centrului exista si seturi de tulpini de microorganisme din colectiile internationale (ATCC - American Type Culture Collection, BCCM - Belgian Co-ordinated Collections of Microorganisms, DSMZ - Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen etc), dintre care unele cu vectori utilizati in experimentele de biologie moleculara.

Mai mult decat atat, colectia de tulpini microbiene a Microgen este afiliata la World Federation of Culture Collections (WFCC). Directorul Microgen (Prof.dr. Tatiana Vassu) face parte din Comitetul International al WFCC.

Subliniem faptul ca in toate proiectele stiintifice desfasurate in cadrul Microgen au fost si sunt realizate cercetari de taxonomie polifazica. Astfel, pentru identificarea taxonomica a tulpinilor microbiene izolate din diverse ecosisteme sunt realizate, atat studii de taxonomie conventionala, cat si analize de nivel molecular pe acizi nucleici (procent molar de guanina+citozina in ADN cromozomal, RFLP pe ADN cromozomal, profil plasmidial si pattern de restrictie pe ADN plasmidial, PCR pentru amplificarea genei pentru ARN ribozomal de 16S, precum si analize ARDRA pe ampliconii 16S; la tulpinile de drojdii se efectueaza electrocariotipare, profilul plasmidelor 2m-like si al plasmidelor ARN, precum si pattern de restrictie pe ADN mitocondrial). Toate aceste analize de nivel molecular sunt efectuate cu ajutorul unei aparaturi standardizate international, aparatura existenta in baza de echipamente a Microgen. Pana in prezent insa, Microgen nu dispune de sisteme standardizate international pentru testele de taxonomie conventionala : in dotarea Microgen nu exista nici unul din cele 2 sisteme, API sau BIOLOG. Avand in vedere aria domeniilor abordate de Microgen, este de preferat sistemul BIOLOG.

In concluzie, s-a desprins cu pregnanta necesitatea achizitionarii sistemului BIOLOG (sub forma MicroStation System), fapt asigura o mult mai performanta activitate stiintifica a Centrul de cercetare, formare si consultanta in Microbiologie, Genetica si Biotehnologie (MICROGEN).

Mentionam ca nici unul din variantele sistemului BIOLOG nu exista in Bucuresti.

Centrul Microgen este format din cadre didactice si cercetatori stiintifici, o buna parte fiind doctoranzi. Toate temele de doctorat aflate in prezent in derulare in cadrul Microgen presupun si efectuarea de teste de taxonomie conventionala pe tulpini de bacterii si/sau drojdii. Ca urmare, achizitionarea si, respectiv, implementarea unui sistem standardizat si automatizat pentru teste de taxonomie conventionala, asa cum este BIOLOG-MicroStation, va contribui in mod substantial la acuratetea stiintifica a tezelor de doctorat, conducand la o amploare mai larga a pregatirii stiintifice a doctoranzilor respectivi. Achizitionarea unui sistem automatizat de tip BIOLOGva contribui la pregatirea supperioara a studentilor din anii terminali care isi realizeaza lucrarile de diploma si a studentilor de la master care isi fac lucrarile de dizertatie.

Microgen dispune deja de o baza materiala moderna ce permite efectuarea a numeroase analize moleculare necesare caracterizarii si incadrarii taxonomice a diferitelor tulpini de microorganisme. Echipamente si facilitati pentru cultura si conservarea microorganismelor: autoclave, etuve de sterilizare uscata cu control electronic, termostate reglabile, termostat cu agitare magnetica si reglare digitala, boxe sterile, hote sterile cu flux laminar, frigidere, congelatoare (-20^oC) si freezer (-70^oC). Echipamente si facilitati pentru analize de microbiologie generala, imunologie si virologie: seturi de coloranti si kituri de identificare taxonomica, reactivi pentru reactii imunologice. Echipamente si facilitati pentru analize clasice pe microorganisme: microscoape de cercetare IOR, Zeiss, microscoape stiintifice MC-1 (1), ML-4 (10), microscoape cu contrast de faza, microscoape cu sistem de preluare si prelucrare digitala a imaginilor; materiale consumabile pentru asemenea analize si pentru experimente de mutageneza fizica si chimica pe microorganisme. Echipamente si facilitati pentru analize genetice pe diverse tipuri de organisme eucariote superioare: echipamente si facilitati pentru culturi de celule animale si umane; sisteme de microscopie optica, epifluorescenta, contrast de faza; kituri de reactivi pentru coloratii cromosomiale diferentiale, SCE, analize de citogenetica moleculara la diverse specii de plante, animale, om si linii celulare maligne; microscop CETI Triton cu sistem video + software pentru analiza de imagine + baza de date pentru cariotipare automata. Echipamente si facilitati pentru analize de biologie moleculara pe microorganisme: agitatoare magnetice; sisteme de electroforeza a acizilor nucleici; transiluminatoare UV, sisteme de fotografiere a gelurilor ADN in ultraviolet; bai de apa termostatate digital ; microcentrifugi tip Eppendorf cu sisteme de racire; centrifugi de laborator pentru volume de pana la 100 ml; balante analitice cu acuratete pana la zecime de microgram; 3 aparate PCR (thermocycler) pentru amplificarea in vitro a unor fragmente ADN ; ultracentrifuga; electroporator pentru transferul rapid si eficient al ADN la diverse specii de organisme pro- si eucariote; sistem computerizat pentru electrocariotipare la drojdii; spectrofotometre UV-VIS, dintre care unul este computerizat cu accesorii specializate pentru determinarea automata a procentului molar de guanina + citozina din ADN genomic; sisteme software Gel Pro-Analyzer pentru analiza de imagine a gelurilor ADN; sisteme software DNA Ploidy pentru analiza cantitativa a continutului de ADN; sistem software Cario Image pentru analiza metafazica in lumina transmisa sau fluorescenta si constructia manuala a cariotipului uman, animal sau vegetal; sisteme software stiintifice specializate pentru banci de date in Microbiologie, pentru identificari de microorganisme, pentru taxonomie si filogenie microbiana; seturi de micropipete automate cu volum reglabil digital; materiale consumabile pentru analize de biologie moleculara. Echipamente de prelucrare a datelor stiintifice si de editare computerizata: computere PC 686; imprimante cu jet; scannere color A4; programe specializate de prelucrare grafica a datelor stiintifice.

In plus, Centrul de cercetare, formare si consultanta in Microbiologie, Genetica si Biotehnologie are acces total la microscopul electronic cu transmisie (marca PHILIPS) aflat in proprietatea Facultatii de Biologie, Universitatea Bucuresti.

Toate echipamentele existente in dotarea Microgen au fost achizitionate ca urmare a necesitatilor aparute in timpul desfasurarii experimentelor. Colectivul Microgen a dezvoltat in ultimii 7 ani foarte multe proiecte de cercetare stiintifica (o medie de 14 proiecte in fiecare an, dintre care 10 la CNCSIS, 2 la Academia Romana si 2 la fostul MCT, Programele Orizont 2000, Relansin si, in prezent, Programul National de Cercetare, Dezvoltare si Inovare - PNCDI). La acestea se adauga 3 granturi majore de cercetare, tip C, finantate de Banca Mondiala, insumand in total 267.000 USD.

Peste 75% din aceste proiecte se situeaza in domeniul microorganismelor, tematica de cercetare cuprinzand urmatoarele directii :

Studii de microbiologie, biochimie si genetica moleculara pe microorganisme (bacterii si drojdii) cu capacitati de biodegradare.

Studii de biodiversitate microbiana in diverse ecosisteme acvatice si terestre.

Analize de taxonomie moleculara pe acizi nucleici, la microorganisme cu valoare biotehnologica (procent molar G+C, RFLP pe ADN cromozomal, pattern de restrictie pe ADNmt din drojdii, profil plasmidial si pattern de restrictie pe ADN plasmidial la bacterii, electrocariotipare la drojdii prin FIGE).

Constructie de vectori de clonare si exprimare pentru diverse tulpini de drojdii.

Biotehnologii microbiene: obtinerea unor tulpini de drojdii si bacterii cu calitati metabolice de interes economico-industrial (obtinere de substante valoroase prin procese biotehnologice microbiene). Studii de biologie si biotehnologie a unor tulpini de drojdii de laborator si industriale. Obtinerea unor tulpini microbiene ameliorate prin tehnici de clonare moleculara a genelor de interes in vectori hibrizi si de tip shuttle; aplicarea unor tehnici de transfer de material genetic prin electroporare la microorganisme (bacterii, drojdii) pentru ameliorarea unor tulpini cu importanta bio-industriala.

Studii de biologie, biochimie, genetica si taxonomie moleculara la tulpini de bacterii lactice cu valoare biotehnologica: izolarea, caracterizarea si identificarea taxonomica a unor tulpini de bacterii lactice izolate din intestin uman, animal si alimente, obtinere si caracterizare de bacteriocine cu ajutorul bacteriilor lactice, analize de genetica moleculara pe tulpini de bacterii lactice utilizabile ca probiotice, experimente de ameliorare genetica a unor tulpini de bacterii lactice de interes economico-medical.

Analize de microbiologie, biochimie si genetica moleculara pe tulpini de bacterii potential patogene: izolarea si tipizarea unor tulpini de bacterii patogene si diagnosticul infectiilor bacteriene prin metode serologice; studii de taxonomie numerica si moleculara pe bacterii potential patogene; studiul mecanismelor de patogenitate si virulenta la microorganisme patogene; rezistenta bacteriana la antibiotice; analize moleculare pe ADN plasmidial la tulpini de bacterii patogene (profil plasmidial si pattern de restrictie pe ADN plasmidial) si corelarea determinantilor genetici de antibiorezistenta cu profilul plasmidial

Studiul procesului de aderenta bacteriana si a influentei substantelor antimicrobiene asupra acestui proces; analize cantitative si calitative ale procesului de aderenta bacteriana la diferite substraturi.

Analize experimentale ale relatiilor virus-celula gazda; studiul imunitatii antivirale postvaccinale.

Studii de imunochimie si imunocitologie.

Nu in ultimul rand, Microgen a fost preocupat pentru creearea si dezvoltarea unei colectii de microorganisme (atat tulpini pentru cercetare fundamentala, cat si tulpini cu valoare biotehnologica).

Prezentam in continuare cateva dintre cele mai importante proiecte stiintifice desfasurate de Microgen in ultimii ani :

Finantare interna :

Organizarea unei (banci) colectii nationale de drojdii de laborator si industriale si caracterizarea lor biochimica si genetica. Faza unica: Studii de taxonomie moleculara pe diverse tulpini de drojdii folosind omologia ADN si procentul molar de guanina-citozina - CNCSU (1997).

Activitati privind organizarea si functionarea, ca autoritate de depozit in scopul procedurii de brevetare in tara si strainatate, a unei colectii de microorganisme de interes biotehnologic si didactic de importanta nationala - acord de parteneriat in cadrul Programului RELANSIN, subprogramul S5 - Calitatea Vietii, 2000-2003.

Dezvoltarea de vectori cu expresie genica la bacteriile acidolactice si levuri. Faza 1:Studiul genetic si taxonomic al unor tulpini bacteriene utilizate ca preparate probiotice. Faza 2: Studiul genetic si taxonomic al unor tulpini de drojdii utilizate ca preparate probiotice. Contract finantat de Institutul de Biologie si Nutritie Animala (IBNA), 1997.

Caracterizarea genetica, biochimica si morfo-fiziologica a unor tulpini de Saccharomyces cerevisiae utilizate in obtinerea de preparate probiotice. Contract cu INCDCF, Bucuresti, 1998.

Identificarea, caracterizarea genetica si incadrarea taxonomica a unor tulpini de drojdii izolate din diferite ecosisteme, CNCSIS, 2001-2003.

Caracterizarea genetica, incadrarea taxonomica si ameliorarea prin tehnici de biologie moleculara a unor tulpini de bacterii lactice utilizate ca probiotice - CNCSIS 1998-2000.

Studii de selectie si caracterizare a unor tulpini de bacterii lactice utilizate pentru imbunatatirea calitatii furajelor, USAMVB, 2000.

Studii de izolare, selectie si caracterizare morfo-fiziologica, biochimica si genetica a unor tulpini de drojdii capabile sa degradeze deseuri petroliere. Contract cu INCDCF, Bucuresti, 1999.

Analiza microbiologica si genetica a unor tulpini bacteriene capabile sa biodegradeze hidrocarburi aromatice. CNCSIS 2000-2002.

Studiul procesului de biodegradare a unor hidrocarburi alifatice de catre tulpini si consortii microbiene. CNCSIS. 2001.

Analiza capacitatii de biodegradare a unor n-alcani cu lanturi de carbon de lungime medie (C10-C18) de catre tulpini si consortii bacteriene izolate din slamuri petroliere. CNCSIS, 2002.

Identificarea, caracterizarea genetica si clasificarea taxonomica a unor tulpini de drojdii izolate din diferite ecosisteme, grant finantat de CNCSIS, 2001-2003.

Finantare externa

Studiul biodegradarii poluantilor quinolinici de catre consortii si tulpini bacteriene pure si analiza biochimica si genetica a procesului de xenodegradare, CNCSIS - Banca Mondiala, Grant tip C (1998-2002) - 67.000 $.

Grant CNCSU tip C, cod 8, cu finantare de la Banca Mondiala: Studiul actiunii substantelor antibiotice asupra capacitatii de aderenta a enterobacteriilor la diferite substraturi (1998-2001).

Grant NATO, nr. 1008 / 19.nov.1998, cu tema: L'étude des interactions entre Bifidobacterium bifidum et les bactéries putréfiantes dans l'intestin du malade précancéreux à polipes.

In prezent, datorita variabilitatii de executie a testelor de fiziologie microbiana, Comitetul International pentru Sistematica Bacteriana (ICBS - International Committee for Bacterial Systematics) a decis in 1996, standardizarea internationala a acestor teste cu ajutorul unor sisteme automatizate. Mai mult chiar, revistele de specialitate cotate cu un scor de peste 15 in catalogul ISI (International Scientific Information) nu mai accepta la publicare lucrari stiintifice ce nu include si rezultate obtinute cu asemenea sisteme automatizate. Pe piata internationala s-au impus 2 sisteme : BIOLOG (produs de Biolog Inc, California SUA) si API (produs de Biomerieux, Paris, Franta), amandoua primind validarea ICBS.

Avand in vedere domeniile stiintifice abordate de Microgen, atentia noastra s-a indreptat catre MicroStation System dezvoltat de Biolog. Acest echipament reprezinta o adevarata statie automatizata de identificare taxonomica microbiana, ale carei principale caracteristici sunt :

MicroStation System este un echipament modern, care permite identificarea si caracterizarea rapida a mai mult de 4000 de specii de bacterii aerobe si anaerobe, drojdii si fungi (unele dintre acestea neputand fi identificate cu alte sisteme), datorita bazelor de date extinse si actualizate in permanenta si datorita celor peste 95 de teste biochimice efectuate. Procesul de identificare este asistat de calculator (cu ajutorul modulului de cititor automat de microplaci inoculate), eliminandu-se astfel erorile datorate interpretarii vizuale subiective;

Analiza unei tulpini microbiene cu MicroStation System are loc foarte rapid, in 4 etape simple: izolarea in cultura pura, pregatirea inocului la densitatea celulara specifica, inoculare urmata de incubare, citirea automata a microplacilor si identificarea microorganismului, spre deosebire de testele clasice, care sunt foarte laborioase, necesitand un volum mare de materiale, munca si timp. Deseori, cu o statie Biolog, rezultatele pot fi obtinute in 4 ore;

sistemul testeaza capacitatea tulpinilor de a utiliza peste 95 de compusi ca sursa unica de carbon;

rezultatele testelor sunt citite automat, cu ajutorul unui reader, ceea ce reduce foarte mult timpul necesar efectuarii acestei etape, si se evita citirile eronate datorate interpretarii vizuale subiective;

interpretarea rezultatelor este asistata de calculator, cu ajutorul softului special Biolog, care compara rezultatele testelor biochimice cu bazele de date proprii (pentru bacterii Gram-pozitive, pentru bacterii Gram-negative, pentru drojdii,) si afiseaza o lista care cuprinde specia cea mai probabila, plus o lista cu alte 10 specii care au modelul de reatie cel mai apropiat de tulpina analizata.

Utilizarea sistemului automatizat Biolog-MicroStation pentru efectuarea testelor de fiziologie microbiana va conduce la rezultate mai acurate de taxonomie conventionala, si, implicit, la o incadrare taxonomica mult mai precisa a unor tulpini de microorganisme (prin corelare cu experimente de taxonomie moleculara si, deci, prin abordari de taxonomie polifazica).

Cresterea preciziei in incadrarea taxonomica a unor tulpini microbiene reprezinta un aspect esential in toate domeniile stiintifice abordate de Microgen pe microorganisme. Astfel :

studiile de monitorizare abiodiversitatatii microbiene a unor ecosisteme terestre si acvatice din tara noastra au inceput sa beneficieze de o acuratete mai inalta, prin faptul ca microorganismele izolate au putut fi caracterizate taxonomic (pe criterii ale taxonomiei conventionale) mult mai precis si standardizat cu ajutorul statiei Biolog;

studiile realizate pe tulpini de microorganisme de interes biotehnologic au beneficiat si ele de un plus de acuratete stiintifica, in mod special, in prima etapa - cea de izolare de tulpini cu potential economic (in procese de bioremediere mediata de microorganisme, procese de obtinere de tulpini de drojdii utile in panificatie, vinificatie, precum si de tulpini de bacterii lactice utilizabile in produse de tip probiotic).

Aceasta gama de activitati stiintifice prezinta importanta nationala deosebita si sunt reprezentative si pe plan international.

Colectivul nostru are o bogata experienta in efectuarea de studii de identificare a diverselor microorganisme, studii realizate in toata complexitatea lor, atat din perspectiva clasica a microbiologiei, cat si din cea moderna, moleculara. Achizitionarea statiei BIOLOG va contribui si in continuare la o mai buna exploatare a resurselor noastre si la imbunatatirea performantelor specialistilor nostri, care vor putea sa-si utilizeze timpul si cunostintele in mod mai eficient. Dupa cum am precizat anterior, rezultatelor obtinute cu ajutorul sistemului BIOLOG sunt completate de specialistii MICROGEN cu date furnizate de analize moleculare.

Centrul nostru de cercetare dispune de o baza materiala moderna, care-i permite sa realizeze o serie de analize in vederea identificarii tulpinilor, analize care se incadreaza in directia taxonomiei polifazice: procent molar de guanina + citozina, analiza ARNr 16S, ARNr 18S (ARDRA, DGGE, SSCP), RFLP pe ADN genomic, RFLP pe ADN mitocondrial, RAPD, FIGE, caractere morfologice coloniale si celulare, coloratii diferentiale pe tulpini microbiene, teste biochimice (laborioase si mari consumatoare de timp si de reactivi).

Laboratorul nostru a infiintat si dezvoltat una dintre putinele banci de microorganisme din tara, banca ce cuprinde tulpini de bacterii, drojdii si fungi filamentosi cu potential biotehnologic crescut:

- microorganisme cu capacitati de biodegradare a diversi compusi din petrol (quinoline, hidrocarburi lineare / ciclice / policiclice, compusi halogenati) si a altor substante xenobiotice; microorganisme implicate in epurarea apelor uzate;

- bacterii lactice importante pentru industria laptelui precum si in obtinerea de produse probiotice;

- drojdii producatoare de biomasa, consumatoare de metanol si grasimi;

- drojdii de vinificatie;

- drojdii cu potential patogen;

- tulpini de microorganisme cu vectori de clonare si de exprimare (unii construiti chiar in acest laborator) care permit manipulari genetice de finete.

Se lucreaza permanent pentru imbogatirea acestei colectii de microorganisme, prin izolarea, identificarea si caracterizarea de noi tulpini cu potential biotehnologic.

Achizitionarea unei statii BIOLOG a permis realizarea de teste biochimice mult mai acurate si in conditii standardizate, precum si identificarea taxonomica a tulpinilor microbiene intr-un timp mult mai scurt.

Completarea bazei materiale a centrului nostru cu un asemenea microtest automatizat se incadreaza in politica tarii noastre de aliniere la standardele internationale si deschid drumul pentru recunoasterea mondiala a colectiei de microorganisme.

Sistemul Biolog-MicroStation s-a dovedit a fi extrem de necesar in realizarea a numeroase proiecte de cercetare stiintifica aflate in derulare si din care mentionam:

1. Studii microbiologice si genetice pe consortii microbiene izolate din soluri si ape poluate cu quinolina, CNCSIS, 2003-2005.
2. Studii moleculare pe tulpini microbiene ce degradeaza hexadecan si dodecan. Analize moleculare de biodiversitate microbiana, CNCSIS, 2004-2006.
3. Incadrarea taxonomica pe baze moleculare a unor fungi de interes biotehnologic, CNCSIS, 2003-2004.
4. Markeri microbiologici si moleculari pentru studiul biodiversitatii si evaluarea factorilor de risc genetic in ecosistemele coastei de N-V a Marii Negre, PNCDI-BIOTECH, 2004-2006.
5. Studii biotehnologice privind eliminarea unor compusi xenobiotici de catre fungi, PNCDI-BIOTECH, 2004-2006.
6. Activitati privind organizarea si functionarea, ca autoritate de depozit in scopul procedurii de brevetare in tara si strainatate, a unei colectii de microorganisme de interes biotehnologic si didactic de importanta nationala, colaborare in cadrul RELANSIN, 2002-2005.

Achizitionarea sistemului BIOLOG a determinat consolidarea infrastructurii deja existenta in dotarea Microgen, permitand astfel accesul la noi fonduri de cercetare.

Microgen colaboreaza de peste 7 ani cu diverse laboratoare de microbiologie din Bucuresti si din tara. Pentru multe din aceste laboratoare, Microgen efectueaza analize, atat de nivel molecular, cat si de taxonomie conventionala. In urma discutiilor avute, toti colaboratorii nostri s-au aratat interesati in a utiliza Biolog-MicroStation pentru realizarea in sistem automatizat a testelor de fiziologie microbiana.